البداية كانت في العام 1982 ، اثناء الاجتياح الاسرائيلي للبنان ، حيث كانت المستشفى بلسماً للجراحات ، ورحمة للمحرومين والمستضعفين في منطقة البقاع عامة وبعلبك خاصة ، دون تمييز بين انسان وآخر ، حيث الحرمان والاهمال ، وفقدان الرعاية الصحية اللازمة في ظل العدوان .
واستمرت المستشفى في مركزها المؤقت الذي اقيم في منطقة رأس العين ، بتقديم خدماتها الطبية على كافة المستويات لكافة اطياف الشعب وفئاته ، حتى انتقلت الى مبناها الجديد في العام 1999 .
وبلغت عدد الحالات المرضية التي تلقت العلاج والخدمة الطبية في المستشفى حوالي 1.500.000 حالة مرضية.